Here is a list of all documented functions with links to the class documentation for each member:

A

B

C

D

E

F

G

H

I

J

K

L

M

N

O

P

Q

R

S

T

U

V

W

~

- s -

• saveOptionValues() : JsonWidget
• scale() : Camera, PLYVisitor
• scanCoordinates() : Molecule
• scanDirectory() : PackageManager
• scene() : GLRenderer
• sceneModel() : GLWidget
• scfType() : GaussianSet
• schoenflies() : SpaceGroups
• scriptFilePath() : InputGenerator, InterfaceScript, PythonScript
• searchSystemPathForFile() : FileBrowseWidget
• searchSystemPathForFiles() : FileBrowseWidget
• sendRequest() : JsonRpcClient
• serialize() : LayerData
• serverId() : BatchJob
• serverName() : JsonRpcClient
• set() : Color3f, Constraint, PersistentAtom< Molecule_T >, PersistentBond< Molecule_T >
• setActiveCubeIndex() : Molecule
• setActiveGLWidget() : ActiveObjects
• setActiveLayer() : Layer
• setActiveLayerId() : LayerModel
• setActiveMolecule() : LayerManager, ActiveObjects
• setActiveSetStep() : GaussianSet
• setActiveTool() : GLWidget
• setActiveWidget() : ExtensionPlugin, ToolPlugin, ActiveObjects
• setAdditionalInputFiles() : JobObject
• setAlign() : TextProperties
• setAlpha() : TextProperties
• setAnchor() : TextLabel2D, TextLabel3D
• setAngle() : FragmentTools
• setArc() : ArcStrip
• setArcSector() : ArcSector
• setAromatic() : SmilesFormat, SmilesWriter
• setAtomicNumber() : AtomTemplate< Molecule_T >, Molecule, RWMolecule
• setAtomicNumbers() : Molecule, RWMolecule
• setAtomLabel() : Molecule, RWMolecule
• setAtomLabels() : Molecule
• setAtomMaps() : SmilesFormat, SmilesWriter
• setAtomPosition2d() : Molecule
• setAtomPosition3d() : Molecule, RWMolecule
• setAtomPositions2d() : Molecule
• setAtomPositions3d() : Molecule, RWMolecule
• setAtomSelected() : Molecule, RWMolecule
• setAttributeArray() : ShaderProgram
• setAVector() : UnitCell
• setAxisColor() : ChartWidget
• setAxisDigits() : ChartWidget
• setAxisLimits() : ChartWidget
• setAxisLogScale() : ChartWidget
• setBackgroundColor() : ChartWidget, Scene
• setBasisSet() : Molecule
• setBatchMode() : InputGeneratorWidget, MoleQueueWidget
• setBinary() : PLYVisitor
• setBlue() : TextProperties
• setBold() : TextProperties
• setBondLabel() : Molecule, RWMolecule
• setBondLabels() : Molecule
• setBondOrder() : Molecule, RWMolecule
• setBondOrders() : Molecule, RWMolecule
• setBondPair() : Molecule, RWMolecule
• setBondPairs() : Molecule, RWMolecule
• setBooleanOption() : JsonWidget
• setBVector() : UnitCell
• setCamera() : ExtensionPlugin, InterfaceScript
• setCellMatrix() : CrystalTools, UnitCell
• setCellParameters() : UnitCell
• setCellVolume() : RWMolecule
• setCenter() : PLYVisitor
• setChainAngle() : FragmentTools
• setChainDistance() : FragmentTools
• setChainTorsion() : FragmentTools
• setColor() : AtomTemplate< Molecule_T >, Molecule, Residue, ColorButton, RWMolecule, ArrowGeometry, DashedLineGeometry, LineStripGeometry, MeshGeometry, WideLineGeometry
• setColorRgb() : TextProperties
• setColorRgba() : TextProperties
• setColors() : Mesh, Molecule
• setConstraints() : Molecule
• setCount() : GaussianSet
• setCube() : Mesh, VolumeGeometry
• setCustomElementMap() : Molecule
• setCVector() : UnitCell
• setCylinderSides() : TessellatingVisitor
• setData() : Cube, Molecule
• setDataMap() : Molecule
• setDebug() : InputGenerator, InterfaceScript, PythonScript
• setDefaultPythonInterpreter() : PythonScript
• setDefaultTool() : GLWidget
• setDensityMatrix() : GaussianSet
• setDescription() : JobObject
• setDialogTitle() : ColorButton
• setDielectric() : ChargeModel
• setDirty() : Scene
• setDisplayUnit() : EnergyUnits
• setDistance() : FragmentTools
• setDistanceUnit() : CoordinateBlockGenerator
• setDouble() : PropertyMap
• setDoubles() : PropertyMap
• setElectronCount() : BasisSet
• setElectronType() : GaussianSetTools
• setElement() : ElementDetail, PeriodicTableView
• setEnabled() : PluginLayerManager, ScenePlugin
• setFileName() : BackgroundFileFormat
• setFilePathOption() : JsonWidget
• setFloatOption() : JsonWidget
• setFocus() : Camera
• setFontFamily() : TextProperties
• setFontSize() : ChartWidget
• setFontStyles() : TextProperties
• setForceVector() : AtomTemplate< Molecule_T >, Molecule, RWMolecule
• setForceVectors() : Molecule
• setFormalCharge() : AtomTemplate< Molecule_T >, Molecule, RWMolecule
• setFormalCharges() : Molecule
• setFormat() : GenericHighlighter::Rule
• setFractionalCoordinates() : CrystalTools
• setFrozenAtom() : Molecule
• setFrozenAtomAxis() : Molecule
• setFunctionalName() : GaussianSet
• setGLRenderer() : ToolPlugin
• setGLWidget() : ToolPlugin
• setGreen() : TextProperties
• setHAlign() : TextProperties
• setHallNumber() : Molecule
• setHeterogen() : Residue
• setHybridization() : AtomTemplate< Molecule_T >, Molecule, RWMolecule
• setHybridizations() : Molecule
• setHydrogenMode() : SmilesFormat, SmilesWriter
• setIcon() : ToolPlugin
• setIdentifier() : DefaultModel
• setIdentity() : Camera
• setInputFile() : JobObject
• setInputGeneratorOptions() : BatchJob
• setInputGeneratorScript() : InputGeneratorDialog, InputGeneratorWidget
• setInt() : PropertyMap
• setIntegerOption() : JsonWidget
• setInteractive() : RWMolecule
• setInterfaceScript() : InterfaceWidget
• setInts() : PropertyMap
• setIsotope() : AtomTemplate< Molecule_T >, Molecule, RWMolecule
• setIsotopes() : Molecule
• setIsoValue() : Mesh
• setItalic() : TextProperties
• setJobTemplate() : MoleQueueWidget
• setLabelText() : TimedProgressDialog
• setLayer() : AtomTemplate< Molecule_T >
• setLayerLocked() : LayerModel
• setLayerVisible() : LayerModel
• setLegendLocation() : ChartWidget
• setLimits() : Cube
• setLineRadius() : TessellatingVisitor
• setLineWidth() : ChartWidget, DashedLineGeometry
• setMask() : EnergyCalculator
• setMaskFromMolecule() : EnergyCalculator
• setMatrix() : PropertyMap
• setMinFilter() : Texture2D
• setModelView() : Camera
• setMolecularOrbitalEnergy() : BasisSet
• setMolecularOrbitalNumber() : GaussianSet
• setMolecularOrbitalOccupancy() : BasisSet
• setMolecularOrbitals() : GaussianSet
• setMolecule() : EnergyCalculator, LennardJones, UFF, AtomTyper< OutputType >, BasisSet, InputGeneratorDialog, InputGeneratorWidget, BackgroundFileFormat, ExtensionPlugin, JsonWidget, ToolPlugin, GLWidget
• setMoleQueueOptions() : BatchJob
• setName() : BasisSet, Mesh
• setNormals() : Mesh
• setOpacity() : CylinderGeometry, DashedLineGeometry, LineStripGeometry, MeshGeometry, SphereGeometry, WideLineGeometry
• setOption() : JsonWidget
• setOptionDefaults() : JsonWidget
• setOptions() : FileFormat, InputGenerator
• setOptionsJson() : InterfaceScript
• setOrder() : BondTemplate< Molecule_T >
• setOrthographicScale() : Camera
• setOtherMesh() : Mesh
• setPackageInfo() : PythonScript
• setParent() : Drawable, Node
• setPartialCharges() : Molecule
• setPixelHeight() : TextProperties
• setPixelRatio() : GLRenderer, GLRenderVisitor, SolidPipeline, TextLabelBase
• setPosition2d() : AtomTemplate< Molecule_T >
• setPosition3d() : AtomTemplate< Molecule_T >
• setPositiveColor() : VolumeGeometry
• setPreserveArgb() : QtTextRenderStrategy
• setProgram() : JobObject
• setProgressScanning() : PythonScript
• setProjection() : Camera
• setProjectionType() : Camera
• setProperty() : AtomTemplate< Molecule_T >, BondTemplate< Molecule_T >
• setQuad() : Quad, QuadOutline
• setQueue() : JobObject
• setQueueList() : MoleQueueQueueListModel
• setRadius() : TextLabel3D
• setRadiusScale() : ArrowGeometry
• setRed() : TextProperties
• setRenderPass() : Drawable, GLRenderVisitor
• setResidueColor() : RWMolecule
• setResidueLabel() : Molecule
• setResidueLabels() : Molecule
• setRotationDegreesCW() : TextProperties
• setScale() : PLYVisitor
• setScanCoordinates() : Molecule
• setScene() : ExtensionPlugin
• setScfType() : GaussianSet
• setScriptFilePath() : InputGenerator, InterfaceScript, PythonScript
• setSelected() : AtomTemplate< Molecule_T >
• setSettingsKey() : JsonWidget
• setShowPoints() : ChartWidget
• setSize() : Graph
• setSource() : Shader
• setSourceUnit() : EnergyUnits
• setSpaceGroup() : SpaceGroups
• setSpecification() : CoordinateBlockGenerator
• setSpectra() : Molecule
• setSphereLevelRange() : TessellatingVisitor
• setSphereSubdivisions() : TessellatingVisitor
• setSpinDensityMatrix() : GaussianSet
• setStable() : Mesh
• setString() : PropertyMap
• setStringListOption() : JsonWidget
• setStringOption() : JsonWidget
• setStrings() : PropertyMap
• setSymmetryLabels() : BasisSet
• setTableOption() : JsonWidget
• setTessellationTolerance() : TessellatingVisitor
• setText() : TextLabelBase
• setTextOption() : JsonWidget
• setTextProperties() : TextLabelBase
• setTextRenderStrategy() : GLRenderer, GLRenderVisitor
• setTextureSampler() : ShaderProgram
• setTheoryName() : BasisSet
• setThreshold() : Hdf5DataFormat
• setTickLabels() : ChartWidget
• setTimeStep() : Molecule
• setting() : SpaceGroups
• setTools() : GLWidget
• setTorsion() : FragmentTools
• setType() : Constraint, Shader
• setUnderline() : TextProperties
• setUndoStack() : UndoMergeTracker
• setUniformValue() : ShaderProgram
• setUnitCell() : Molecule
• setUnits() : EnergyUnits
• setupWidget() : ScenePlugin
• setUserOptions() : EnergyCalculator
• setVAlign() : TextProperties
• setValue() : Constraint, Cube, Variant, VariantMap, JobObject, TimedProgressDialog
• setVelocities() : Molecule
• setVertices() : Mesh
• setVibrationData() : Molecule
• setVibrationFrequencies() : Molecule
• setVibrationIRIntensities() : Molecule
• setVibrationLx() : Molecule
• setVibrationRamanIntensities() : Molecule
• setViewport() : Camera
• setVisible() : Drawable, Node
• setVolume() : CrystalTools
• setWrappingS() : Texture2D
• setWrappingT() : Texture2D
• setXAxisLimits() : ChartWidget
• setXAxisTitle() : ChartWidget
• setYAxisLimits() : ChartWidget
• setYAxisTitle() : ChartWidget
• shape() : ElementDetail, ElementItem
• show() : TimedProgressDialog
• showAndSelectProgram() : MoleQueueWidget
• showEvent() : InputGeneratorWidget
• size() : Graph, VariantMap, CylinderGeometry, SphereGeometry
• sizeHint() : ChartDialog
• slaterIndices() : SlaterSet
• SlaterSet() : SlaterSet
• smooth() : Mesh
• SolidPipeline() : SolidPipeline
• solidPipeline() : GLRenderer
• source() : Shader
• sourceUnit() : EnergyUnits
• spacing() : Cube
• specificationUrl() : CjsonFormat, CmlFormat, DcdFormat, FileFormat, GromacsFormat, LammpsDataFormat, LammpsTrajectoryFormat, MdlFormat, MMTFFormat, OutcarFormat, PdbFormat, PoscarFormat, SdfFormat, SmilesFormat, TrrFormat, TurbomoleFormat, XyzFormat, GAMESSUSOutput, GaussianCube, GaussianFchk, GenericJson, GenericOutput, MoldenFile, MopacAux, NWChemJson, NWChemLog, ORCAOutput, QCSchema
• spectra() : Molecule
• spectraTypes() : Molecule
• sphereLevelForRadius() : TessellatingVisitor
• sphereMaxEdgeAngle() : TessellatingVisitor
• spheres() : SphereGeometry
• sphereSubdivisions() : TessellatingVisitor
• stable() : Mesh
• stringArrayOption() : FileFormat
• stringNames() : PropertyMap
• stringOption() : FileFormat
• strings() : PropertyMap
• subgraph() : Graph
• subgraphCount() : Graph
• subgraphsCount() : Graph
• submissionError() : MoleQueueWidget
• submissionSuccess() : MoleQueueWidget
• submitJob() : Client, MoleQueueDialog
• submitJobRequest() : MoleQueueWidget
• submitJobResponse() : Client
• submitNextJob() : BatchJob
• success() : BackgroundFileFormat
• supportedOperations() : CjsonFormat, CmlFormat, DcdFormat, FileFormat, GromacsFormat, LammpsDataFormat, LammpsTrajectoryFormat, MdlFormat, MMTFFormat, OutcarFormat, PdbFormat, PoscarFormat, SdfFormat, SmilesFormat, TrrFormat, TurbomoleFormat, XyzFormat, GAMESSUSOutput, GaussianCube, GaussianFchk, GenericJson, GenericOutput, MoldenFile, MopacAux, NWChemJson, NWChemLog, ORCAOutput, QCSchema
• supportsBatch() : EnergyCalculator
• swapAndPop() : Array< T >
• swapAtomIndices() : BasisSet, GaussianSet, SlaterSet
• swapEdgeIndices() : Graph
• swapEntries() : PropertyMap
• swapLayer() : Layer
• swapVertexIndices() : Graph
• symbol() : Elements, EnergyUnits
• symmetrize() : AvoSpglib
• symmetrizeCell() : RWMolecule
• symmetry() : GaussianSet
• symmetryLabels() : BasisSet